日本是全球推動燃料電池尤其是燃料電池汽車發展最積極、最活躍的國家，其原因除日本重視環境保護之外，還由于日本的化石能源匱乏，而燃料電池可以應用于汽車和發電等領域，因此日本政府出臺了一系列發展燃料電池的扶植政策，明確制定燃料電池的發展路線，大力進行燃料電池技術及燃料電池基礎設施建設的投資、補貼和減免稅收。

第一，明確詳細的燃料電池發展路線

2009年，日本發布了《燃料電池汽車和加氫站2015年商業化路線圖》，其中明確了日本燃料電池的商業化進程。2014年，日本出臺的《氫能/燃料電池戰略發展路線圖》明確了氫能三步走發展戰略：第一步從2014年到2025年推廣氫能的適用范圍，計劃到2015年加氫站達到100座，從2015年到2017年之間實現燃料電池車和固體氧化物燃料電池的商業化，到2030年燃料電池裝置使用量達到530萬臺；第二步從2020年中期到2030年，計劃全面實現以氫能發電并且建立大規模的氫能供應系統；第三階段從2040年開始，計劃全面實現零排放的制氫、運氫和儲氫。

第二，對燃料電池強力投資、補貼或減免稅收

日本大力投資燃料電池相關技術的研究和示范推廣，并對加氫站等氫能基礎設施建設和燃料電池汽車進行補貼。

1995年，日本燃料電池的投資只相當于美國的2/3，而在2000年時投資額度已高于美國的20%。2001年，日本宣布首相行動計劃，開發包括燃料電池車在內的新型動力汽車，為該計劃投資6.15億美元以上用于稅收激勵、研發、低息貸款和補貼。

2013年，日本提供5000萬美元以補貼加氫站的建設，建設方最高可獲50%的建站補貼。2014年，日本為每個燃料電池汽車的購買者補貼200萬日元。在過去的30年里，日本政府先后投入數千億日元用于燃料電池汽車和氫能技術的研究和推廣。

預計在2020年之前，日本燃料電池成本減半，2025年燃料電池成本下降到當前的1/4，使得燃料電池汽車的整體價格在200萬日元左右，成為普通消費者樂于接受的價格，并且將加氫站的成本降至每處2億日元。

第三，力推燃料電池領域相關技術的商業化進程

日本在政策規劃和投資補貼等多方面推進燃料電池汽車和加氫站的商業化進程。

2011年，日本13家汽車企業和能源企業簽訂協議，決定合作建設100座加氫站，并力圖降低燃料電池汽車的生產成本，以擴大燃料電池汽車市場。到2015年，日本建成了45座加氫站投入使用，標志了日本燃料電池汽車已經進入了商業化實用階段。2016年，日本經濟產業省在公布的燃料電池汽車普及計劃中指出，計劃到2025年燃料電池汽車的銷售量達到20萬輛，2030年達80萬輛，2025年加氫站數量達到320座，以基本實現燃料電池汽車的商業化。

第四，重點發展家用燃料電池和燃料電池汽車

日本政府積極推動家用燃料電池和燃料電池汽車的發展，鼓勵燃料電池進入千家萬戶。

2002年，日本提出將燃料電池用作家用電源和汽車動力源，要求政府有關部門率先購入燃料電池車。2005年起，日本政府對家用燃料電池熱電聯供項目進行補貼，到2008年，共有3300套家用燃料電池安裝和使用。

2009年起，日本政府為安裝熱電聯供系統的個人或企業補貼140萬日元或減免50%的費用，促進燃料電池技術的普及，預計到2014年末銷售量可達12萬臺。

隨著燃料電池汽車商業化進程的發展，在豐田公司推出首款燃料電池汽車Mirai之后，日本政府為每輛車提供200萬日元的財政補貼，以推進燃料電池汽車在國內的銷售。

第五，以奧運會為契機推動燃料電池汽車發展

據悉，日本將以2020年東京奧運會為契機推廣燃料電池汽車。實現建立“氫能社會示范區”的目標，將拿出452億補貼燃料電池汽車購置和加氫站建設，預計將投放6000輛氫燃料電池乘用車，計劃為奧運村配備100輛以上的氫燃料電池公交車，還逐步將東京的“都營巴士”替換為燃料電池客車，進一步推動燃料電池巴士的應用和產業化。如今，豐田公司已經拿下了奧運會的贊助權并為奧運會期間準備了一系列的燃料電池汽車車型。此外，日本政府指出將在2030年前總共建成500萬套燃料電池供電系統，已建系統將在東京奧運會期間分擔部分電力負荷。